Описание Базы Данных ФикоТоксИД

База данный содержит информацию о токсинах микроводорослей (фикотоксинах). В БД входят как фикотоксины, так и их метаболиты. На текущий момент БД содержит информацию о ЧЧЧ соединений.
БД содержит следующую информацию:
- PTID
Идентификатор соединения в БД PhycoToxID.

- название токсина
Основное название токсина (историческое, не IUPAC). Если соединение является модификацией какого-либо токсина, то название модифицированной формы представлено в формате:
"название токсина", "модификация".

- Синонимы названия токсина
Приведены альтернативные написания основного названия или дополнительные названия. В случае с фикотоксинами существуют случаи, когда одно и то же соединение обнаруживается несколькими авторами, которые относят его к разным группам по названию (например, Decarabamoyl-Neosaxitoxin и Gonyautoxin 7 являются одним и тем же соединением). Также эта колонка содержит дополнительную существенную информацию о токсине, которая не попадает в другие специализированные колонки.

- CAS
CAS номер токсина (для некоторых соединений CAS номер е существует, однако данная колонка находится в разработке и отсутствие CAS номера НЕ ОБЯЗАТЕЛЬНО указывает на то, что он не существует). - Molecular Formula
Молекулярная формула соединения в нейтральной форме

- Structure
Структура соединения. При наведении курсора изображение увеличивается. При нажатии на изображение открывается дополнительное окно со структурой. Можно одновременно открыть неограниченное количество окон со структурой.

- Short Name
Короткое наименование токсина (в разработке, приведены не для всех соединений, для которых существует короткое наименование).

- MW
Моноизотопная масса нейтрального соединения в соответствии с молекулярной формулой

- m/z [M+H]+
m/z положительно-заряженного молекулярного иона для протонированной формы соединения для z=+1

- m/z [M-H]-
m/z отрицательно-заряженного молекулярного иона для депротонированной формы соединения для z=-1

- CID
Compound Identificator в БД PubChem. При нажатии открывается новое окно с соответствующим соединением в БД PubChem. Многие соединения имеют несколько идентификаторов в PubChem. В БД PhycoToxID оставлены либо основные идентификаторы, содержащие максимальное количество информации по соединению по сравнению с другими идентификаторами того же соединения, либо приведено несколько идентификаторов одновременно. Если по ссылке на соединение по CID в БД PubCHem отсутствует ожидаемая информация (например, для части CID БД PubCHem содержит информацию о токсичности), имеет смысл посмотреть другие идентификаторы для того же соединения через поиск по названию в БД PubChem.

- Toxin Calss
Все токсины распределены по классам в соответствии с особенностями химической структуры. Названия классов токсинов взяты из статьи по фикотоксинам в Wikipedia.

- Toxin Group
Все токсины распределены по группам в соответствтии со структурой и названием. По мере работы над БД будут дополняться и изменяться.

- Group-defining toxin
Источник данных о токсине. В абсолютном большинстве указан "группа-определяющий" токсин, для которого был проведен поиск по структурной гомологии в БД PubChem. Если источником токсина является текстовый поиск по названию, приведена информация в виде, например, "Saxitoxin (PubChem Text Search)". Если использовался источник информации о токсине, отличный от PubChem, приведена информация об источнике (например, в виде идентификатора PMID статьи в PubMed).

- Producent
Приведена информация о продуцентах токсина (находится в разработке).

Колонки таблицы быть отсортированы по возрастанию/убыванию. Для приведения таблицы в исходный вид требуется отсортировать сначала по Названию токсина, затем по Группе, затем по Классу.

Для Групп токсинов созданы отдельные разделы, где приведена более подробная аналитическая информация, в частности МС спектры в открытых источниках, а также полученные экспериментально авторами БД. Также приведена более подробная информация о биологических особенностях токсинов, включая продуцентов, биологическое действие и пр. Информация доступна по ссылкам в оглавлении, а также справа от названия группы в таблице.